De omschrijving  van de vlag luidt:

“Gevierendeeld over 1/3 van de lengte van de vlag, rood en geel, met in de kwartieren, op gelijke afstanden van de delingslijn, achtereenvolgens een gebroken rad, het bovenste deel van een dubbele adelaar, een vossenkop en een achtpuntige ster, alles in omgekeerde kleuren”. 

Toelichting bij de totstandkoming van de nieuwe vlag van Nieuwkoop

Nadat in november 2007 aan de gemeente Nieuwkoop een wapen werd verleend, is het ontwerp van de gemeentevlag ter hand genomen. Eerst diende er duidelijkheid te bestaan over het wapen waarna de vlag ontworpen kon worden. Net als het wapen, is de vlag bedoeld als onderscheidingsteken van de gemeente. De Stuurgroep Herindeling had als opdracht meegegeven waar mogelijk elementen uit de vlaggen van de gemeenten Liemeer, Nieuwkoop en Ter Aar in het nieuwe ontwerp op te nemen.

Evenals het wapen, is de nieuwe gemeentevlag ontworpen door Gert-Jan Pieterse.

Voorschriften

De gemeentevlag moet voldoen aan een aantal voorschriften. Aangezien de gemeente over een vlag wil beschikken die voldoet aan de heraldische eisen, is aan de Hoge Raad van Adel advies gevraagd over het ontwerp van de vlag.

Anders dan bij het gemeentewapen heeft de Hoge Raad van Adel een adviserende rol bij de totstandkoming van de gemeentevlag.De gemeenteraad stelt het model van de vlag vast.

Nog meer als voor het gemeentewapen, is eenvoud van belang voor een vlag. Dit heeft te maken met een goede herkenbaarheid, ook op grotere afstanden. De vlag dient verder overeenkomsten te hebben met het wapen. 

De verhouding van de vlag is 2:3.

De gemeentevlag gebruikt de gemeente bij officiële gelegenheden.

Systematiek 

Bij de vlag is dezelfde systematiek aangehouden als bij het wapen. Ook de vlag is in vier kwartieren verdeeld met dezelfde figuren in de kwartieren.

Vanwege de eenvoud zijn van de vos en de dubbele adelaar alleen de bovenste delen afgebeeld en de achtpuntige ster zonder de drie bellen.  

De kleuren rood en goud van het wapen worden op de vlag weergegeven als rood en geel.De kleuren rood en geel waren ook de beide kleuren van de vlaggen van de voormalige gemeenten Liemeer, Nieuwkoop en Ter Aar en komen dus terug op de nieuwe gemeentevlag.

Het gebroken rad uit de vlag van Nieuwkoop is opgenomen (kwartier I) op de vlag evenals de dubbelkoppige adelaar van Zevenhoven (Liemeer) (kwartier II) en de achtpuntige ster van Nieuwveen (Liemeer) (kwartier IV). De vlag van de

voormalige gemeente Ter Aar bestond uitsluitend uit verticale banen rood en geel.

Deze kleuren zijn overgenomen op de nieuwe vlag. De vossenkop is nieuw toegevoegd (kwartier III).